Caracterització del splicing alternatiu en el càncer de mama triple negatiu

Abstract

[cat] El càncer és una malaltia on es dona una divisió descontrolada de les cèl·lules. Algunes de les característiques que doten a les cèl·lules canceroses d’aquesta habilitat es troben regulades per l’splicing, un procés que permet a les cèl·lules expressar múltiples variants d’un sol gen, denominades isoformes. En aquest treball s’ha estudiat la rellevància en el càncer de mama triple negatiu, un subtipus de càncer de mama molt agressiu. Investigacions anteriors van generar un model cel·lular deficitari en un factor de splicing concret, PTBP1. Així, aquest estudi s’ha focalitzat en identificar els canvis en l’expressió gènica que s’han donat com a conseqüència de la disrupció de PTBP1. S’han combinat tècniques de bioinformàtica i de biologia molecular per estudiar els nivells d’expressió d’un subconjunt de gens que podrien veure’s afectats pel rol de PTBP1. L’estudi indica que la disrupció de PTBP1 a MDA-MB-231 provoca la modulació del 15% dels gens i, què d’entre aquells gens que no presenten variació a nivell global, es donen canvis en les isoformes. L’estudi ha validat per PCR els resultats en set dels nou gens caracteritzats. Aquest estudi emfatitza la rellevància que té el procés de splicing en general i PTBP1 en particular en els canvis d’expressió gènica associats a la progressió tumoral.

[spa] El cáncer es una enfermedad en la que se da una división descontrolada de las células. Algunas de las características que dotan a las células cancerosas de ésta habilidad se encuentran reguladas por el splicing, un proceso que permite a las células expresar múltiples variantes de un solo gen, denominadas isoformas. En este trabajo se ha estudiado la relevancia en el cáncer de mama triple negativo, un subtipo de cáncer de mama muy agresivo. Investigaciones anteriores generaron un modelo celular deficitario en un factor de splicing concreto, PTBP1. Así, este estudio se ha focalizado en identificar los cambios en la expresión génica que se han dado como consecuencia de la disrupción de PTBP1. Se han combinado técnicas de bioinformática y de biología molecular para estudiar los niveles de expresión de un subconjunto de genes que podrían verse afectados por el rol de PTBP1. El estudio indica que la disrupción de PTBP1 a MDA-MB-231 provoca la modulación del 15% de los genes y, que de entre aquellos genes que no presentan variación a nivel global, se dan cambios en las isoformas. El estudio ha validado por PCR los resultados en siete de los nueve genes caracterizados. Este estudio enfatiza la relevancia que tiene el proceso de splicing en general y PTBP1 en particular en los cambios de expresión génica asociados a la progresión tumoral.

[eng] Cancer is a disease characterised by uncontrolled cell division. Some hallmarks that give cancer cells this ability are regulated by splicing, a process that allows cells to express multiple variants of a single gene, called transcript. This work has studied the relevance of triple-negative breast cancer, a very aggressive subtype of breast cancer. Previous research generated a cell model deficient in a particular splicing factor, PTBP1. Thus, this study has focused on identifying changes in gene expression resulting from the PTBP1 disruption. Bioinformatics and molecular biology techniques have been combined to study the expression levels of a subset of genes that could be affected by the role of PTBP1. The study indicates that PTBP1 disruption in MDA-MB-231 cells causes modulation of 15% of the genes and, among those genes that do not show global variation, changes occur in the transcripts. The study has validated the results in seven of the nine characterized genes by PCR. This study emphasizes the relevance of the splicing process in general, and PTBP1 in particular, in the gene expression changes associated with tumor progression.