Caracterización de la microbiota del Ferreret (Alytes Muletensis) a partir de datos de seguenciación masiva de ADN fecal

Abstract

[spa] En este trabajo se partió de la recepción de los archivos brutos resultantes de la secuenciación masiva de ADN bacteriano a partir de 8 muestras de heces del ferreret (Alytes muletensis) recolectadas en fresco en 3 localidades de la isla de Mallorca. Después se procedió al procesamiento bioinformático de las secuencias con la finalidad de caracterizar la microbiota presente en las muestras. Este procesamiento incluyó: control de calidad, detección y eliminación de secuencias quiméricas, unión de las secuencias complementarias, asignación taxonómica, rarefacción y análisis de diversidad y estadístico. Los filos de bacterias más abundantes en la microbiota de A. muletensis fueron Bacteroidetes, Firmicutes, Proteobacteria y Actinobacteria, que coinciden con los resultados obtenidos en otros estudios sobre la microbiota de diferentes anuros. Se realizó un test PERMANOVA en el que se compararon las distancias en cuanto a composición de las comunidades microbianas de las muestras agrupadas según la localidad donde se recogieron y no se encontraron diferencias significativas (p = 0,4)

[cat] Aquest treball va començar amb la recepció dels arxius bruts resultants de la seqüenciació masiva d’ADN bacterià a partir de 8 mostres de femta del ferreret (Alytes muletensis) recol·lectades en fresc a 3 localitats de l’illa de Mallorca. Després es va procedir al processament bioinformàtic de les seqüencies amb la finalitat de caracteritzar la microbiota present a les mostres. Dit processament va incloure: control de qualitat, detecció i eliminació de seqüències quimèriques, unió de les seqüències complementàries, assignació taxonómica, rarefacció i anàlisi de diversitat i estadística. Els filums més abundants varen ser Bacteroidetes, Firmicutes, Proteobacteria i Actinobacteria, que coincideixen amb els resultats obtinguts en altres estudis sobre la microbiota de diferents anurs. Per finalizar es va realizar un test PERMANOVA amb el que es varen comparar les distàncies en quant a composición de les comunitats microbianes de les mostres agrupades segons la localitat on es varen recollir; no es varen trobar diferències significatives (p = 0,4)

[eng] This study began with the reception of raw files obtained from the massive sequencing of bacterial DNA from 8 freshly collected fecal samples of the midwife toad (Alytes muletensis) from 3 different localities in Mallorca. The raw sequences underwent bioinformatic processing to characterize the microbiota present in the samples. This processing included quality control, chimera detection, paired-end read merging, taxonomic assignment, rarefaction, and diversity and statistical analysis. The most abundant bacterial phyla were Bacteroidetes, Firmicutes, Proteobacteria, and Actinobacteria. These results were consistent with findings from other studies on the microbiota of different anurans. Subsequently, a PERMANOVA test was conducted; the samples were grouped by locality, and the distances based on microbial composition were compared. The results of the PERMANOVA test indicated no significant differences in the microbiota composition among the 3 localities (p = 0.4).