Caracterización molecular basada en secuencias de ADN de la microbiota intestinal de de metacrangonyx longipes, una especie de crustáceos, acuático subterráneo endémica de Baleares

Abstract

[spa] La especie Metacrangonyx longipes pertenece a la familia de crustáceos anfípodos estigobiontes de origen marino Metacrangonyctidae. Esta especie es endémica de las islas Mallorca y Menorca. Conocer la composición de su microbiota supondría un avance significativo en el estudio científico de la biología, dado que las especies de menor tamaño y endémicas están menos estudiadas. En el presente Trabajo de Fin de Grado, se pone a punto una metodología basada en códigos de barras de ADN (DNA barcoding) para la identificación de la microbiota intestinal de M. longipes en base a la región V4 del gen 16S ARNr. Los resultados demuestran que se ha logrado extraer y amplificar con éxito ADN microbiano a partir del tracto digestivo de un individuo de M. longipes. Además, se ha observado una relación entre la microbiota intestinal de M. longipes y su entorno, destacando la presencia del género Cellulosilyticum

[cat] L'espècie Metacrangonyx longipes pertany a la família de crustacis amfípodes estigobionts d'origen marí Metacrangonyctidae. Aquesta espècie és endèmica de les illes Mallorca i Menorca. Conèixer la composició de la seva microbiota suposaria un avenç significatiu en l'estudi científic de la biologia, atès que les espècies més petites i endèmiques estàn menys estudiades. En aquest Treball de Fi de Grau, es posa a punt una metodologia basada en codis de barres d'ADN (DNA barcoding) per a la identificació de la microbiota intestinal de M. longipes en base a la regió V4 del gen 16S ARNr. Els resultats demostren que s'ha aconseguit extreure i amplificar amb èxit l'ADN microbià a partir del tracte digestiu d'un individu de M. longipes. A més, s'ha observat una relació entre la microbiota intestinal de M. longipes i el seu entorn, destacant la presència del gènere Cellulosilyticum

[eng] The Metacrangonyx longipes species belongs to the stygobiont amphipod crustaceans family with marine origin Metacrangonyctidae. This is a Mallorca and Menorca islands endemic species. Knowing its microbiota composition would represent a significant advance in scientific biology study, given that smaller and endemic species are less studied. In this Final Degree Project, a methodology based on DNA barcoding is developed for the intestinal microbiota of M. longipes identification based on the 16S rRNA gene V4 region. The results prove that microbial DNA has been extracted and amplified successfully from the digestive tract of an M. longipes individual. Furthermore, a relationship has been observed between the intestinal microbiota of M. longipes and its environment, highlighting the presence of the Cellulosilyticum genus