Selección y evaluación de cepas de la colección pseudomonas UIB con potencial actividad en la protección de plantas contra Xylella fastidiosa

Abstract

[spa] El género Pseudomonas incluye numerosas especies con capacidad demostrada como agentes de biocontrol, gracias a la producción de metabolitos secundarios con propiedades antimicrobianas. En este trabajo se evaluó el potencial antagonista de diversas cepas tipo del género Pseudomonas sensu lato, así como otras cepas relacionadas, frente a Xylella fastidiosa subsp. fastidiosa (Xff) en condiciones in vitro. Se realizaron ensayos en placa en medio BCYE, enfrentando cultivos de la cepa XYL 1701/18 con cepas del género Pseudomonas. Los potenciales antagonistas fueron seleccionados en función de información bibliográfica previa sobre su actividad antimicrobiana. Las lecturas se realizaron entre los días 7 y 14. En los casos en los que se observó inhibición del crecimiento se realizó una resiembra en BCYE como prueba confirmatoria. Se realizaron lecturas semanales durante cuatro semanas para diferenciar entre efectos bacteriostáticos y bactericidas. Varias cepas mostraron actividad bacteriostática, mientras que un subconjunto más reducido presentó un efecto bactericida. Las cepas con actividad bactericida pertenecen al subgrupo Pseudomonas chlororaphis y son filogenéticamente cercanas a Pseudomonas protegens CHA0T , cepa que, en ensayos previos realizados por el grupo de investigación de la UIB, ha mostrado capacidad antagonista frente a Xylella fastidiosa in vivo. En nuestros ensayos, estas cepas detuvieron completamente el crecimiento de XYL 1701/18 en placa, y la ausencia de crecimiento tras la resiembra confirmó su efecto bactericida. Además, se realizaron análisis comparativos de los genomas mediante herramientas de minería genómica mediante antiSMASH, así como análisis del pan-genoma, para detectar diferencias en los perfiles funcionales y conjuntos de genes relacionados con la síntesis de metabolitos secundarios que podrían estar implicados con la actividad antagonista frente a X. fastidiosa. Estos resultados apuntan al potencial de ciertas cepas tipo del género Pseudomonas como agentes de biocontrol frente a Xylella fastidiosa

[eng] The genus Pseudomonas includes numerous species with proven potential as biocontrol agents, due to their production of secondary metabolites with antimicrobial properties. In this study, the antagonistic potential of various type strains of the genus Pseudomonas sensu lato, as well as other related strains, was evaluated against Xylella fastidiosa subsp. fastidiosa (Xff) under in vitro conditions. Plate assays were carried out on BCYE medium, confronting cultures of the strain XYL 1701/18 with Pseudomonas strains. The potential antagonists were selected based on previous literature describing their antimicrobial activity. Readings were taken between days 7 and 14. In cases where growth inhibition was observed, a subculturing on BCYE was performed as a confirmatory test. Weekly readings were conducted for four weeks to distinguish between bacteriostatic and bactericidal effects. Several strains showed bacteriostatic activity, while a smaller subset exhibited a bactericidal effect. The strains with bactericidal activity belong to the Pseudomonas chlororaphis subgroup and are phylogenetically close to Pseudomonas protegens CHA0T , a strain that, in previous in vivo trials carried out by the UIB research group, showed antagonistic activity against Xylella fastidiosa. In our assays, these strains completely stopped the growth of XYL 1701/18 on plates, and the lack of growth after subculturing confirmed their bactericidal effect. In addition, comparative genomic analyses were performed using genome mining tools such as antiSMASH, as well as pangenome analysis, to identify differences in functional profiles and gene clusters related to the synthesis of secondary metabolites that could be involved in the antagonistic activity against X. fastidiosa. These results highlight the potential of certain Pseudomonas type strains as biocontrol agents against Xylella fastidiosa